受金融危机和甲型HINI流感双重影响，巴新航空公司部分国际航线和国内航线乘客人数减少，尤其是新加坡、吉隆坡航线。国内一些地区基础设施发展受限也影响了国内航线的客流。巴新航空宣布自7月2日起调整部分航线起飞时间，并取消莫尔斯比港至吉隆坡直飞航线，该航线并入莫尔斯比港－新加坡航线。此举将降低巴新航空的运营成本。